环状ecDNA促进可利用的染色质和高癌基因表达
2019-11-25   阅读:505   来源:Nature

在癌症中,癌基因通常在染色体外DNA(ecDNA)的粒子上扩增1,2,但是我们对ecDNA的结构及其对基因调控的影响的理解是有限的。在这里,通过整合超微结构成像,远程光学作图和全基因组测序的计算分析,我们证明了环状ecDNA的结构。泛癌分析显示,在ecDNA上编码的癌基因是肿瘤转录组中表达最高的基因之一,将增加的拷贝数与高转录水平联系起来。染色质状态的定量评估表明,尽管ecDNA被包装到具有完整域结构的染色质中,但它缺乏典型的染色体高阶压缩,并且显示出显着增强的染色质可及性。此外,显示ecDNA与活跃的染色质具有明显更多的超远程相互作用,这提供了对环状ecDNA结构如何影响癌基因功能的了解,并

#染色质 #基因 #癌症
©2020年07月15日 12:21:14
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