DeepVariant:Google开发的人工智能基因序列分析工具
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  • 名称:DeepVariant
  • 网址:https://github.com/google/deepvariant
  • DeepVariant是由Google Brain及Verily公司的联合团队,历时两年多研发的深度学习工具。研究人员通过将工作量巨大的碎片结果拼接问题,转变成谷歌擅长的图像分类问题,使用谷歌现有技术和专业知识完成识别工作。DeepVariant用专门的深度神经网络来识别HTS结果中DNA测序数据里的碱基变异位点,在准确率上和精确度上,比传统的比对拼接方法都高出许多。

    DeepVarient工作流程

    2016年,DeepVarient还在PrecisionFDA Truth Challenge中赢得了最高SNP性能奖(Highest SNP Performance)。在那之后,Google Brain团队又将错误率降低了50%。DeepVarient的成功表明,在基因组学中,深度学习可以被用来自动训练比复杂的手工程系统更好的平台。

    DeepVariant的开源发布是机器学习促进基因组学发展的最新迹象。DeepVariant现在作为开源软件,可以鼓励加速使用这项技术来解决现实问题。为了实现这一目标,Google Cloud Platform(GCP)上部署了DeepVariant workflow,用户可以在当前的计算环境中探索和评估DeepVariant的功能,同时也提供了可扩展的基于云的解决方案,以满足即使是最大的基因组数据集的需求。

    未来几年,人工智能将有助于医学在许多方面取得巨大的飞跃,并有机会从图像或病历中挖掘许多不同种类的医学数据。例如,一个人类医生可能错过的疾病。

    ©2023年02月07日 10:17:20
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